Anaconda升级与Spyder升级与报错处理（镜像源更新设置）

女爷i 2023-06-26 03:27 14阅读 0赞

具体操作如下：

step1：首先在菜单中，以管理员的身份启动 Anaconda Prompt，如图1所示；

![format_png][]  
step2：升级conda(升级Anaconda前需要先升级conda)命令为：

conda update conda

step3：升级anconda命令为：

conda update anaconda

step4：升级python命令为：

conda update python

step5：升级spyder命令为：

conda update spyder

*  安装/更新单个库：以安装 更新 scipy 为例

pip install scipy
    pip install scipy --upgrade
    # 或者
    conda install scipy
    conda update scipy

step6：

conda update --all

ps:

使用conda安装软件，总是出现无法安装的提示：

Collecting package metadata: failed
    
    UnavailableInvalidChannel: The channel is not accessible or is invalid.
      channel name: anaconda/cloud/bioconda
      channel url: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
      error code: 404
    
    You will need to adjust your conda configuration to proceed.
    Use `conda config --show channels` to view your configuration's current state,
    and use `conda config --show-sources` to view config file locations.

![watermark_type_ZmFuZ3poZW5naGVpdGk_shadow_10_text_aHR0cHM6Ly96eWM4OC5ibG9nLmNzZG4ubmV0_size_16_color_FFFFFF_t_70][]

原来清华大学停止了镜像服务：  
关于停止Anaconda镜像服务的通知  
[https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/news/close-anaconda-service/][https_mirror.tuna.tsinghua.edu.cn_news_close-anaconda-service]  
解决方法：  
使用

conda config --remove-key channels

将提示的镜像源全部删除即可。

增加r、conda-forge、bioconda的channels：

conda config --add channels r # R软件包
    conda config --add channels conda-forge # Conda社区维护的不在默认通道中的软件
    conda config --add channels bioconda # 生物信息学类工具

在执行 **conda config** 命令的时候  
会在当前用户目录下创建 **.condarc** 文件，可以查看更换源前后该文件内容的变化。

**查看配置文件**

conda config --show

添加中科大源

conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
    
    conda config --set show_channel_urls yes

显示安装的频道

conda config --set show_channel_urls yes

查看已经添加的channels

conda config --get channels

已添加的channel在哪里查看

vim ~/.condarc

此时，目录 C:\\Users<你的用户名> 下就会生成配置文件.condarc，内容如下：

channels:
      - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
      - defaults
    show_channel_urls: true

各系统都可以通过修改用户目录下的 `.condarc` 文件:

清华大学开源软件镜像站 [https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/][https_mirror.tuna.tsinghua.edu.cn_help_anaconda]

channels:
      - defaults
    show_channel_urls: true
    default_channels:
      - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
      - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
      - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
    custom_channels:
      conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
      msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
      bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
      menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
      pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
      simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

上海交通大学开源镜像站

channels:
      - https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
      - https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
      - https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    ssl_verify: true

中国科学技术大学 USTC Mirror

channels:
      - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
      - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
      - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    ssl_verify: true

————————————————

### 2、修改配置文件 ###

删除上述配置文件 .condarc 中的第三行，然后保存，最终版本文件如下：

channels:
      - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    show_channel_urls: true

### 3、查看是否生效 ###

通过命令

conda info

查看当前配置信息

当然, 也可以用这个命令进行搜索

conda search spyder

安装完成后，可以用“which 软件名”来查看该软件安装的位置：

which gatk

### 如需要安装特定的版本: ###

conda install 软件名=版本号
    conda install spyder=3.7

这时conda会先卸载已安装版本，然后重新安装指定版本。

查看已安装软件:

conda list

更新指定软件:

conda update spyder

卸载指定软件:

conda remove spyder

==========================慎用===========================

异常终极解决方式：

File "E:\software\Anaconda3\lib\json\__init__.py", line 348, in loads
            return _default_decoder.decode(s)
          File "E:\software\Anaconda3\lib\json\decoder.py", line 337, in decode
            obj, end = self.raw_decode(s, idx=_w(s, 0).end())
          File "E:\software\Anaconda3\lib\json\decoder.py", line 355, in raw_decode
            raise JSONDecodeError("Expecting value", s, err.value) from None
        json.decoder.JSONDecodeError: Expecting value: line 362873 column 16 (char 10796875)

**\#\# 删除索引缓存、锁定文件、未使用过的包和tar包。**

conda clean --all

==================================

conda环境使用基本命令

conda update -n base conda        #update最新版本的conda
    conda create -n xxxx python=3.5   #创建python3.5的xxxx虚拟环境
    conda activate xxxx               #开启xxxx环境
    conda deactivate                  #关闭环境
    conda env list                    #显示所有的虚拟环境
    conda info --envs                 #显示所有的虚拟环境

查看指定包可安装版本信息命令  
参考：https://blog.csdn.net/qq\_35203425/article/details/79965389  
查看tensorflow各个版本：（查看会发现有一大堆TensorFlow源，但是不能随便选，选择可以用查找命令定位）

anaconda search -t conda tensorflow

查看指定包可安装版本信息命令

anaconda show <USER/PACKAGE>

查看指定anaconda/tensorflow版本信息

anaconda show tensorflow

输出结果会提供一个下载地址，使用下面命令就可指定安装1.8.0版本tensorflow

conda install --channel https://conda.anaconda.org/anaconda tensorflow=1.8.0

更新，卸载安装包：

conda list         #查看已经安装的文件包
    conda list  -n xxx       #指定查看xxx虚拟环境下安装的package
    conda update xxx   #更新xxx文件包
    conda uninstall xxx   #卸载xxx文件包

删除虚拟环境

conda remove -n xxxx --all   //创建xxxx虚拟环境

清理（conda瘦身）  
conda clean就可以轻松搞定！第一步：通过conda clean -p来删除一些没用的包，这个命令会检查哪些包没有在包缓存中被硬依赖到其他地方，并删除它们。第二步：通过conda clean -t可以将删除conda保存下来的tar包。

conda clean -p      //删除没有用的包
    conda clean -t      //删除tar包
    conda clean -y -all //删除所有的安装包及cache

参考：https://blog.csdn.net/menc15/article/details/71477949

重命名env  
Conda是没有重命名环境的功能的, 要实现这个基本需求, 只能通过愚蠢的克隆-删除的过程。  
切记不要直接mv移动环境的文件夹来重命名, 会导致一系列无法想象的错误的发生!

conda create --name newname --clone oldname      //克隆环境
    conda remove --name oldname --all      //彻底删除旧环境

conda自动开启/关闭激活  
参考：https://www.cnblogs.com/clemente/p/11231539.html

conda activate   #默认激活base环境
    conda activate xxx  #激活xxx环境
    conda deactivate #关闭当前环境
    conda config --set auto_activate_base false  #关闭自动激活状态
    conda config --set auto_activate_base true  #关闭自动激活状态

Conda 安装本地包  
有时conda或pip源下载速度太慢，install a过程中会中断连接导致压缩包下载不全，  
此时，我们可以用浏览器等工具先下载指定包再用conda或pip进行本地安装

#pip 安装本地包
    pip install   ～/Downloads/a.whl
    #conda 安装本地包
    conda install --use-local  ~/Downloads/a.tar.bz2

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[https_mirror.tuna.tsinghua.edu.cn_help_anaconda]: https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/