Java语言开发dcm4che开源库解析dicom医疗影像文件

水深无声 2021-11-22 13:52 3494阅读 0赞

## dcm4che简介 ##

dcm4che是一个用Java语言开发的用于处理dicom标准下文件，dicom文件就是我们在医院中常见的X光片，CT等医疗影像文件，这些医疗影像文件中有很多患者的信息如姓名、年龄、性别、婚姻状态、就诊日期、就诊医生、就诊医院等等，包含非常多的信息。但这种文件的解析不用用我们通常的方法进行解析，必须要按照dicom标准进行解析，但这个标准还是挺复杂的。  
如果对dicom标准感兴趣的话，我在网上看到了一本我们国人翻译的dicom3标准的书，我放到了GitHub [Release dicom标准中文版 · weiyangtang/dcm4cheSystem · GitHub][Release dicom_ _ weiyangtang_dcm4cheSystem _ GitHub]  
在dcm4che前面有C++版本的DCMTK，现在也有Python版本的pydicom，dcm4che的优点在于Java语言是全球最多人使用的开发语言也是工业界用的最多的语言，dcm4che开源库受到Java开发者的欢迎。  
GitHub地址：[GitHub - dcm4che/dcm4che: DICOM Implementation in JAVA][GitHub - dcm4che_dcm4che_ DICOM Implementation in JAVA]  
\[外链图片转存失败(img-mPsouskA-1563959079281)([https://raw.githubusercontent.com/weiyangtang/images/master/20190724162155.png][https_raw.githubusercontent.com_weiyangtang_images_master_20190724162155.png])\]

> 我主要是用到了dicom文件的解析和storescp、storescu格式化发送dicom的功能

## dicom文件解析 ##

我先把代码贴出来，你们电脑上跑基本都会有依赖找不到的问题

import org.dcm4che3.data.Attributes;
    import org.dcm4che3.data.Tag;
    import org.dcm4che3.io.DicomInputStream;
    
    import java.io.File;
    import java.io.IOException;
    
    /** * @Auther: tangweiyang * @Date: 2019/7/24 16:31 * @Description: */
    public class DicomDemo { 
        public static void getTagByFile(String pathFile) { 
            try { 
                File file = new File(pathFile);
                DicomInputStream dis = new DicomInputStream(file);
                Attributes fmi = dis.readFileMetaInformation();
                Attributes attrs = dis.readDataset(-1, -1);
                System.out.println("Series Instance UID:" + attrs.getString(Tag.SeriesInstanceUID));
                System.out.println("Study Instance UID:" + attrs.getString(Tag.StudyInstanceUID));
                System.out.println("Patient ID:" + attrs.getString(Tag.PatientID));
                System.out.println("Patient Name" + attrs.getString(Tag.PatientName));
                System.out.println("SOP Instance UID:" + attrs.getString(Tag.SOPInstanceUID));
                System.out.println(attrs.getString(Tag.ImageType));
            } catch (IOException e) { 
                e.printStackTrace();
                return;
            }
        }
    
        public static void main(String[] args) { 
        
            String dicomFile = "D:\\工作\\dcm_data\\upload\\021130082089.dcm";
            getTagByFile(dicomFile);
        }
    }

maven依赖

<dependency>
        <groupId>org.dcm4che</groupId>
        <artifactId>dcm4che-core</artifactId>
        <version>3.3.4</version>
    </dependency>

效果就如下

Series Instance UID:1.2.392.200046.100.2.1.47095101944.150601085457.2
    Study Instance UID:1.2.392.200046.100.2.1.47095101944.150601085457
    Patient ID:7628
    Patient Name??
    SOP Instance UID:1.2.392.200046.100.2.1.47095101944.150601085457.2.1.1
    DERIVED

中文好像会乱码，暂时还没解决

> 在你电脑上很有可能依赖包无法导入，原因在于maven依赖无法下载，至少我在两台Linux服务器上都无法下载依赖  
> 解决方案一：手动下载dcm4che-core-3.3.2.jar，复制粘贴到C:\\Users\\你的用户名.m2\\repository\\org\\dcm4che\\dcm4che-core\\3.3.2  
> 解决方案二：手动下载dcm4che-core-3.3.2.jar，在项目resource路径下新建一个libs的文件夹，复制粘贴进去，

<dependency>
                <groupId>org.dcm4che</groupId>
                <artifactId>dcm4che-core</artifactId>
                <version>3.3.2</version>
                <scope>system</scope>
                <systemPath>${project.basedir}/src/main/resources/lib/dcm4che-core-3.3.2.jar</systemPath>
            </dependency>

[Release dicom_ _ weiyangtang_dcm4cheSystem _ GitHub]: https://github.com/weiyangtang/dcm4cheSystem/releases/tag/dicom%E6%A0%87%E5%87%86%E4%B8%AD%E6%96%87%E7%89%88
[GitHub - dcm4che_dcm4che_ DICOM Implementation in JAVA]: https://github.com/dcm4che/dcm4che
[https_raw.githubusercontent.com_weiyangtang_images_master_20190724162155.png]: https://raw.githubusercontent.com/weiyangtang/images/master/20190724162155.png